ID | 107365 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Build | bionetgen-2.9.0-3.fc40 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Name | bionetgen | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Version | 2.9.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Release | 3.fc40 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Epoch | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Arch | src | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Draft | False | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary | Software for rule-based modeling of biochemical systems | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | BioNetGen is software for the specification and simulation of rule-based models of biochemical systems, including signal transduction, metabolic, and genetic regulatory networks. The BioNetGen language has recently been extended to include explicit representation of compartments. A review of methods for rule-based modeling is available in Science Signaling (Sci. STKE, 18 July 2006, Issue 344, p. re6). BioNetGen is presently a mixture of Perl and C++. Network generation is currently implemented in Perl, the network simulator is C++, and a new language parser is being developed with ANTLR. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Build Time | 2024-05-03 06:48:45 GMT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Size | 40.11 MB | |||||||||||||||||||||||||||||||||
cff417bc5099f573aefaaa29ecc0c751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
License | GPLv3 and BSD and MIT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Buildroot | f40-build-75630-4872 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Provides |
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Obsoletes | No Obsoletes | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Conflicts | No Conflicts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Requires |
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Recommends | No Recommends | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Suggests | No Suggests | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Supplements | No Supplements | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Enhances | No Enhances | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Files |
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Component of | No Buildroots |